Himura Kenshin adalah pendekar pedang legendaris yang telah berhenti membunuh orang dengan pedangnya. Sebaliknya, dia menggunakan pedang bermata tumpul. Dia mencoba menjalani kehidupan yang damai dengan Kaoru yang menjalankan sekolah ilmu pedang di desa mereka. Pada 1879, Kenshin dan para sekutunya menghadapi musuh terkuat mereka: mantan adik iparnya, Enishi Yukishiro, serta kroni-kroninya, yang telah bersumpah menuntut balas.