Ceritanya tentang maba bernama Kitahara Iori yang niatnya menikmati kehidupan kuliahnya yang menyenangkan, dengan datang ke kedai bernama Grand Blue. Di sana dia bertemu sepupu cantiknya yang bernama Chisa. Ketika Iori sedang senang-senangnya, tanpa diketahui olehnya bahwa Grand Blue juga tempat bagi komunitas menyelam!